K-Means と MiniBatchKMeans の比較

はじめに

この実験では、2 つのクラスタリングアルゴリズム：K-Means と MiniBatchKMeans を比較します。K-Means は、機械学習で広く使用される人気のあるクラスタリングアルゴリズムです。MiniBatchKMeans は、K-Means のバリアントで、高速ですが、やや異なる結果を得ます。両方のアルゴリズムを使用してデータセットをクラスタリングし、結果をプロットします。また、2 つのアルゴリズムで異なるラベルが付けられたポイントもプロットします。

VM のヒント

VM の起動が完了したら、左上隅をクリックしてノートブックタブに切り替え、Jupyter Notebook を使って練習しましょう。

時々、Jupyter Notebook が読み込み終了するまで数秒待つ必要があります。Jupyter Notebook の制限により、操作の検証は自動化できません。

学習中に問題がある場合は、Labby にお問い合わせください。セッション後にフィードバックを提供してください。すぐに問題を解決いたします。

Skills Graph

データの生成

まず、クラスタリングするデータのブロブを生成します。

import numpy as np
from sklearn.datasets import make_blobs

np.random.seed(0)

batch_size = 45
centers = [[1, 1], [-1, -1], [1, -1]]
n_clusters = len(centers)
X, labels_true = make_blobs(n_samples=3000, centers=centers, cluster_std=0.7)

KMeans を使ったクラスタリングの計算

KMeans を使ってクラスタリングを計算します。

import time
from sklearn.cluster import KMeans

k_means = KMeans(init="k-means++", n_clusters=3, n_init=10)
t0 = time.time()
k_means.fit(X)
t_batch = time.time() - t0

MiniBatchKMeans を使ったクラスタリングの計算

MiniBatchKMeans を使ってクラスタリングを計算します。

from sklearn.cluster import MiniBatchKMeans

mbk = MiniBatchKMeans(
    init="k-means++",
    n_clusters=3,
    batch_size=batch_size,
    n_init=10,
    max_no_improvement=10,
    verbose=0,
)
t0 = time.time()
mbk.fit(X)
t_mini_batch = time.time() - t0

クラスタ間の同等性の確立

MiniBatchKMeans と KMeans アルゴリズムの両方で、同じクラスタに同じ色を付けたいと思います。最も近いものごとにクラスタ中心をペアにしましょう。

from sklearn.metrics.pairwise import pairwise_distances_argmin

k_means_cluster_centers = k_means.cluster_centers_
order = pairwise_distances_argmin(k_means.cluster_centers_, mbk.cluster_centers_)
mbk_means_cluster_centers = mbk.cluster_centers_[order]

k_means_labels = pairwise_distances_argmin(X, k_means_cluster_centers)
mbk_means_labels = pairwise_distances_argmin(X, mbk_means_cluster_centers)

結果のプロット

結果をプロットします。

import matplotlib.pyplot as plt

fig = plt.figure(figsize=(8, 3))
fig.subplots_adjust(left=0.02, right=0.98, bottom=0.05, top=0.9)
colors = ["#4EACC5", "#FF9C34", "#4E9A06"]

## KMeans
ax = fig.add_subplot(1, 3, 1)
for k, col in zip(range(n_clusters), colors):
    my_members = k_means_labels == k
    cluster_center = k_means_cluster_centers[k]
    ax.plot(X[my_members, 0], X[my_members, 1], "w", markerfacecolor=col, marker=".")
    ax.plot(
        cluster_center[0],
        cluster_center[1],
        "o",
        markerfacecolor=col,
        markeredgecolor="k",
        markersize=6,
    )
ax.set_title("KMeans")
ax.set_xticks(())
ax.set_yticks(())
plt.text(-3.5, 1.8, "train time: %.2fs\ninertia: %f" % (t_batch, k_means.inertia_))

## MiniBatchKMeans
ax = fig.add_subplot(1, 3, 2)
for k, col in zip(range(n_clusters), colors):
    my_members = mbk_means_labels == k
    cluster_center = mbk_means_cluster_centers[k]
    ax.plot(X[my_members, 0], X[my_members, 1], "w", markerfacecolor=col, marker=".")
    ax.plot(
        cluster_center[0],
        cluster_center[1],
        "o",
        markerfacecolor=col,
        markeredgecolor="k",
        markersize=6,
    )
ax.set_title("MiniBatchKMeans")
ax.set_xticks(())
ax.set_yticks(())
plt.text(-3.5, 1.8, "train time: %.2fs\ninertia: %f" % (t_mini_batch, mbk.inertia_))

## Initialize the different array to all False
different = mbk_means_labels == 4
ax = fig.add_subplot(1, 3, 3)

for k in range(n_clusters):
    different += (k_means_labels == k)!= (mbk_means_labels == k)

identical = np.logical_not(different)
ax.plot(X[identical, 0], X[identical, 1], "w", markerfacecolor="#bbbbbb", marker=".")
ax.plot(X[different, 0], X[different, 1], "w", markerfacecolor="m", marker=".")
ax.set_title("Difference")
ax.set_xticks(())
ax.set_yticks(())

plt.show()

まとめ

この実験では、2 つのクラスタリングアルゴリズム：K-Means と MiniBatchKMeans を比較する方法を学びました。両方のアルゴリズムを使ってデータセットをクラスタリングし、結果をプロットしました。また、2 つのアルゴリズムで異なるラベルが付けられた点もプロットしました。この比較は、2 つのアルゴリズムの違いを理解し、自分たちのニーズに最適なアルゴリズムを選ぶのに役立ちます。