Trazar curvas de calibración
Entrenamos cada uno de los cuatro modelos con el pequeño conjunto de datos de entrenamiento y trazamos curvas de calibración utilizando las probabilidades predichas del conjunto de datos de prueba. Las curvas de calibración se crean agrupando las probabilidades predichas, luego se traza la probabilidad predicha media en cada grupo contra la frecuencia observada ('fracción de positivos'). Debajo de la curva de calibración, trazamos un histograma que muestra la distribución de las probabilidades predichas o, más específicamente, el número de muestras en cada grupo de probabilidades predichas.
import numpy as np
from sklearn.svm import LinearSVC
from sklearn.calibration import CalibrationDisplay
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
from sklearn.naive_bayes import GaussianNB
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.gridspec import GridSpec
## Create classifiers
lr = LogisticRegression()
gnb = GaussianNB()
svc = NaivelyCalibratedLinearSVC(C=1.0, dual="auto")
rfc = RandomForestClassifier()
clf_list = [
(lr, "Logistic"),
(gnb, "Naive Bayes"),
(svc, "SVC"),
(rfc, "Random forest"),
]
fig = plt.figure(figsize=(10, 10))
gs = GridSpec(4, 2)
colors = plt.get_cmap("Dark2")
ax_calibration_curve = fig.add_subplot(gs[:2, :2])
calibration_displays = {}
markers = ["^", "v", "s", "o"]
for i, (clf, name) in enumerate(clf_list):
clf.fit(X_train, y_train)
display = CalibrationDisplay.from_estimator(
clf,
X_test,
y_test,
n_bins=10,
name=name,
ax=ax_calibration_curve,
color=colors(i),
marker=markers[i],
)
calibration_displays[name] = display
ax_calibration_curve.grid()
ax_calibration_curve.set_title("Calibration plots")
## Add histogram
grid_positions = [(2, 0), (2, 1), (3, 0), (3, 1)]
for i, (_, name) in enumerate(clf_list):
row, col = grid_positions[i]
ax = fig.add_subplot(gs[row, col])
ax.hist(
calibration_displays[name].y_prob,
range=(0, 1),
bins=10,
label=name,
color=colors(i),
)
ax.set(title=name, xlabel="Mean predicted probability", ylabel="Count")
plt.tight_layout()
plt.show()