Перезапуск перечитывает конфигурацию, не затрагивая текущий процесс.

Это два названия одной и той же операции остановки и запуска.

Перезагрузка конфигурации просит работающую службу перечитать конфигурацию, а перезапуск останавливает и запускает процесс службы заново.

Перезагрузка конфигурации удаляет пакет службы, а перезапуск устанавливает его заново.