uniq может читать только символы, упорядоченные по алфавиту.

sort вычисляет количество вхождений, которое uniq лишь отображает.

uniq сравнивает соседние строки, а сортировка объединяет одинаковые строки в группы.

Сортировка удаляет исходный файл, чтобы uniq не мог его изменить.