カーネルリッジ回帰をプロットする

はじめに

このチュートリアルでは、Python の人気のある機械学習ライブラリである Scikit-Learn を使って、Kernel Ridge Regression (KRR) と Support Vector Regression (SVR) を比較します。両モデルは、カーネルトリックを用いて非線形関数を学習します。KRR と SVR は、損失関数とフィッティング方法において異なります。我々は、正弦波の目的関数と、5番目のデータポイントに強いノイズが加えられた人工的なデータセットを使います。

VM のヒント

VM の起動が完了したら、左上隅をクリックして Notebook タブに切り替えて、Jupyter Notebook を使った練習にアクセスします。

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Skills Graph

サンプルデータを生成する

我々は、正弦波の目的関数と、5番目のデータポイントに強いノイズが加えられたデータセットを生成します。

import numpy as np

## サンプルデータを生成する
rng = np.random.RandomState(42)
X = 5 * rng.rand(10000, 1)
y = np.sin(X).ravel()

## ターゲットにノイズを加える
y[::5] += 3 * (0.5 - rng.rand(X.shape[0] // 5))

X_plot = np.linspace(0, 5, 100000)[:, None]

カーネルベースの回帰モデルを構築する

我々は、Scikit-Learn の GridSearchCV を使って KRR と SVR モデルを構築し、最適なハイパーパラメータを見つけます。

from sklearn.model_selection import GridSearchCV
from sklearn.svm import SVR
from sklearn.kernel_ridge import KernelRidge

train_size = 100

## SVR モデル
svr = GridSearchCV(
    SVR(kernel="rbf", gamma=0.1),
    param_grid={"C": [1e0, 1e1, 1e2, 1e3], "gamma": np.logspace(-2, 2, 5)},
)

## KRR モデル
kr = GridSearchCV(
    KernelRidge(kernel="rbf", gamma=0.1),
    param_grid={"alpha": [1e0, 0.1, 1e-2, 1e-3], "gamma": np.logspace(-2, 2, 5)},
)

SVR と Kernel Ridge Regression の時間を比較する

我々は、ステップ 2 で見つけた最適なハイパーパラメータを使って、SVR と KRR モデルのフィッティングと予測の時間を比較します。

import time

## SVR をフィッティングする
t0 = time.time()
svr.fit(X[:train_size], y[:train_size])
svr_fit = time.time() - t0

## SVR モデルの最適なパラメータとスコアを表示する
print(f"Best SVR with params: {svr.best_params_} and R2 score: {svr.best_score_:.3f}")
print("SVR complexity and bandwidth selected and model fitted in %.3f s" % svr_fit)

## KRR をフィッティングする
t0 = time.time()
kr.fit(X[:train_size], y[:train_size])
kr_fit = time.time() - t0

## KRR モデルの最適なパラメータとスコアを表示する
print(f"Best KRR with params: {kr.best_params_} and R2 score: {kr.best_score_:.3f}")
print("KRR complexity and bandwidth selected and model fitted in %.3f s" % kr_fit)

## SVR のサポートベクトル比を計算する
sv_ratio = svr.best_estimator_.support_.shape[0] / train_size
print("Support vector ratio: %.3f" % sv_ratio)

## SVR を使って予測する
t0 = time.time()
y_svr = svr.predict(X_plot)
svr_predict = time.time() - t0
print("SVR prediction for %d inputs in %.3f s" % (X_plot.shape[0], svr_predict))

## KRR を使って予測する
t0 = time.time()
y_kr = kr.predict(X_plot)
kr_predict = time.time() - t0
print("KRR prediction for %d inputs in %.3f s" % (X_plot.shape[0], kr_predict))

結果を見る

RBF カーネルの複雑さ/正則化と帯域幅の両方がグリッドサーチを使って最適化された場合、KRR と SVR の学習モデルを可視化します。

import matplotlib.pyplot as plt

sv_ind = svr.best_estimator_.support_
plt.scatter(
    X[sv_ind],
    y[sv_ind],
    c="r",
    s=50,
    label="SVR support vectors",
    zorder=2,
    edgecolors=(0, 0, 0),
)
plt.scatter(X[:100], y[:100], c="k", label="data", zorder=1, edgecolors=(0, 0, 0))
plt.plot(
    X_plot,
    y_svr,
    c="r",
    label="SVR (fit: %.3fs, predict: %.3fs)" % (svr_fit, svr_predict),
)
plt.plot(
    X_plot, y_kr, c="g", label="KRR (fit: %.3fs, predict: %.3fs)" % (kr_fit, kr_predict)
)
plt.xlabel("data")
plt.ylabel("target")
plt.title("SVR versus Kernel Ridge")
_ = plt.legend()

学習と予測時間を可視化する

我々は、異なるサイズの学習セットに対する KRR と SVR のフィッティングと予測の時間を可視化します。

_, ax = plt.subplots()

sizes = np.logspace(1, 3.8, 7).astype(int)
for name, estimator in {
    "KRR": KernelRidge(kernel="rbf", alpha=0.01, gamma=10),
    "SVR": SVR(kernel="rbf", C=1e2, gamma=10),
}.items():
    train_time = []
    test_time = []
    for train_test_size in sizes:
        t0 = time.time()
        estimator.fit(X[:train_test_size], y[:train_test_size])
        train_time.append(time.time() - t0)

        t0 = time.time()
        estimator.predict(X_plot[:1000])
        test_time.append(time.time() - t0)

    plt.plot(
        sizes,
        train_time,
        "o-",
        color="r" if name == "SVR" else "g",
        label="%s (train)" % name,
    )
    plt.plot(
        sizes,
        test_time,
        "o--",
        color="r" if name == "SVR" else "g",
        label="%s (test)" % name,
    )

plt.xscale("log")
plt.yscale("log")
plt.xlabel("Train size")
plt.ylabel("Time (seconds)")
plt.title("Execution Time")
_ = plt.legend(loc="best")

学習曲線を可視化する

我々は、KRR と SVR の学習曲線を可視化します。

from sklearn.model_selection import LearningCurveDisplay

_, ax = plt.subplots()

svr = SVR(kernel="rbf", C=1e1, gamma=0.1)
kr = KernelRidge(kernel="rbf", alpha=0.1, gamma=0.1)

common_params = {
    "X": X[:100],
    "y": y[:100],
    "train_sizes": np.linspace(0.1, 1, 10),
    "scoring": "neg_mean_squared_error",
    "negate_score": True,
    "score_name": "Mean Squared Error",
    "std_display_style": None,
    "ax": ax,
}

LearningCurveDisplay.from_estimator(svr, **common_params)
LearningCurveDisplay.from_estimator(kr, **common_params)
ax.set_title("Learning curves")
ax.legend(handles=ax.get_legend_handles_labels()[0], labels=["SVR", "KRR"])

plt.show()

まとめ

このチュートリアルでは、Scikit-Learn を使って Kernel Ridge Regression (KRR) と Support Vector Regression (SVR) を比較しました。我々は、正弦波状の目的関数と 5 番目のデータポイントに強いノイズが加えられたデータセットを生成しました。我々は、Scikit-Learn の GridSearchCV を使って KRR と SVR モデルを構築し、最適なハイパーパラメータを見つけました。見つけた最適なハイパーパラメータを使って、SVR と KRR モデルのフィッティングと予測の時間を比較しました。RBF カーネルの複雑さ/正則化と帯域幅の両方がグリッドサーチを使って最適化された場合、KRR と SVR の学習モデルを可視化しました。また、異なるサイズの学習セットに対する KRR と SVR のフィッティングと予測の時間を可視化しました。最後に、KRR と SVR の学習曲線を可視化しました。