Emacs はファイルをバッファーで開きます。編集ではまずバッファーが変わり、保存すると現在の内容が関連付けられたパス名へ書き込まれます。パーミッション、競合するディスク上の変更、そのほかのエラーで書き込みに失敗することがあるため、ミニバッファーのメッセージを読んでください。