Dendrogramme de regroupement hiérarchique

Introduction

Dans ce laboratoire, nous allons apprendre à tracer le dendrogramme correspondant à un regroupement hiérarchique en utilisant AgglomerativeClustering et la méthode dendrogramme disponible dans scipy.

Conseils sur la machine virtuelle

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Si vous rencontrez des problèmes pendant l'apprentissage, n'hésitez pas à demander à Labby. Donnez votre feedback après la session, et nous résoudrons rapidement le problème pour vous.

Skills Graph

Importez les bibliothèques nécessaires

Nous allons commencer par importer les bibliothèques nécessaires pour ce laboratoire.

import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.cluster import AgglomerativeClustering

Chargez le jeu de données

Nous allons utiliser la fonction load_iris() du module sklearn.datasets pour charger le jeu de données iris.

iris = load_iris()
X = iris.data

Créez le modèle

Ensuite, nous allons créer le modèle de regroupement hiérarchique en utilisant la fonction AgglomerativeClustering() du module sklearn.cluster.

model = AgglomerativeClustering(distance_threshold=0, n_clusters=None)

Ajustez le modèle

Nous allons ajuster le modèle de regroupement hiérarchique en utilisant la méthode fit() de l'objet modèle.

model = model.fit(X)

Tracez le dendrogramme

Nous allons tracer le dendrogramme à l'aide de la fonction dendrogram() du module scipy.cluster.hierarchy et de la fonction plot_dendrogram() définie dans le code original.

plt.title("Hierarchical Clustering Dendrogram")
plot_dendrogram(model, truncate_mode="level", p=3)
plt.xlabel("Number of points in node (or index of point if no parenthesis).")
plt.show()

Sommaire

Dans ce laboratoire, nous avons appris à tracer le dendrogramme correspondant à un regroupement hiérarchique en utilisant AgglomerativeClustering et la méthode dendrogramme disponible dans scipy. Nous avons chargé le jeu de données iris, créé un modèle de regroupement hiérarchique et ajusté le modèle. Enfin, nous avons tracé le dendrogramme à l'aide de la fonction dendrogram() du module scipy.cluster.hierarchy et de la fonction plot_dendrogram() définie dans le code original.